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Phenome
Genome
Laboratory
A pedigree-like
charting tool
that displays SSLP differences for more than 150 genotyped rat strains can be accessed
here
.
Note
: all SSLP markers were manually selected from the
RGD site
for the criteria of being highly polymorphic among the rat strains listed there.
The phylogenetic tree of 132 laboratory rat strains
.
The tree was calculated through maximum parsimony analysis implemented in
PAUP 4.0b10.
Data display is managed using
TreeView's
radial tree function.
Genetic profiles of rat strains that are included in our repository cover all chromosomes (except for chromosome Y). Direct access to our genotyping database can be achieved by clicking on the chromosome number below.
Chr. 1
Chr. 2
Chr. 3
Chr. 4
Chr. 5
Chr. 6
Chr. 7
Chr. 8
Chr. 9
Chr. 10
Chr. 11
Chr. 12
Chr. 13
Chr. 14
Chr. 15
Chr. 16
Chr. 17
Chr. 18
Chr. 19
Chr. 20
Chr. X
More information on the marker can be accessed by clicking on each marker name. This will take you to
The Rat Genome Database.
Chr.1
Chr.2
Chr.3
Chr.4
Chr.5
Chr.6
Chr.7
Chr.8
Chr.9
Chr.10
Chr.11
D1Arb29
D2Mgh13
D3Arb10
D4Arb10
D5Mgh2
D6Arb3
D7Mgh11
D8Mgh7
D9Mit3
D10Mgh15
D11Arb4
D1Arb39
D2Mgh24
D3Arb18
D4Arb15
D5Mgh20
D6Arb5
D7Mgh9
D8Mit5
D9Mit6
D10Mgh3
D11Mgh3
D1Mgh12
D2Rat103
D3Mgh25
D4Arb23
D5Mgh21
D6Rat62
D7Mit12
D8Rat101
D9Mit7
D10Mit5
D11Mit2
D1Mgh19
D2Rat106
D3Mit11
D4Arb25
D5Mgh23
D6Mit1
D7Mit2
D8Rat107
D9Rat106
D10Rat103
D11Mit9
D1Mit4
D2Rat118
D3Mit2
D4Arb35
D5Mgh26
D6Mit6
D7Mit20
D8Rat11
D9Rat108
D10Rat104
D11Rat21
D1Mit8
D2Rat124
D3Mit9
D4Arb7
D5Mgh27
D6Mit9
D7Rat103
D8Rat156
D9Rat110
D10Rat121
D11Rat33
D1Rat122
D2Rat126
D3Rat1
D4Mgh1
D5Mgh8
D6Rat105
D7Rat107
D8Rat16
D9Rat121
D10Rat125
D11Rat6
D1Rat126
D2Rat134
D3Rat114
D4Mgh13
D5Rat106
D6Rat115
D7Rat128
D8Rat165
D9Rat129
D10Rat126
D11Rat63
D1Rat149
D2Rat150
D3Rat122
D4Mgh16
D5Rat116
D6Rat12
D7Rat135
D8Rat179
D9Rat132
D10Rat133
D11Rat91
D1Rat159
D2Rat183
D3Rat130
D4Mgh18
D5Rat125
D6Rat136
D7Rat195
D8Rat184
D9Rat158
D10Rat135
D11Rat92
D1Rat20
D2Rat187
D3Rat148
D4Mgh22
D5Rat128
D6Rat14
D7Rat27
D8Rat185
D9Rat16
D10Rat136
D11Rat97
D1Rat208
D2Rat189
D3Rat157
D4Mgh30
D5Rat138
D6Rat149
D7Rat32
D8Rat31
D9Rat178
D10Rat153
D1Rat214
D2Rat194
D3Rat166
D4Mgh32
D5Rat141
D6Rat160
D7Rat35
D8Rat36
D9Rat22
D10Rat193
D1Rat221
D2Rat202
D3Rat169
D4Mit20
D5Rat147
D6Rat3
D7Rat42
D8Rat43
D9Rat60
D10Rat165
D1Rat231
D2Rat205
D3Rat176
D4Rat101
D5Rat36
D6Rat33
D7Rat66
D8Rat49
D9Rat72
D10Rat195
D1Rat237
D2Rat21
D3Rat193
D4Rat102
D5Rat41
D6Rat36
D7Rat67
D8Rat55
D9Rat78
D10Rat198
D1Rat27
D2Rat212
D3Rat204
D4Rat112
D5Rat49
D6Rat41
D7Rat69
D8Rat62
D9Rat79
D10Rat198
D1Rat270
D2Rat215
D3Rat227
D4Rat142
D5Rat60
D7Rat81
D8Rat8
D10Rat216
D1Rat277
D2Rat222
D3Rat24
D4Rat166
D5Rat68
D7Rat95
D8Rat90
D10Rat223
D1Rat278
D2Rat241
D3Rat25
D4Rat168
D5Rat71
D10Rat54
D1Rat290
D2Rat248
D3Rat34
D4Rat17
D5Rat83
D10Rat93
D1Rat295
D2Rat250
D3Rat56
D4Rat176
D5Rat95
D10Rat95
D1Rat30
D2Rat251
D3Rat80
D4Rat178
D5Rat98
D1Rat320
D2Rat253
D3Rat82
D4Rat209
D1Rat338
D2Rat256
D3Rat97
D4Rat24
D1Rat410
D2Rat28
D4Rat34
D1Rat452
D2Rat287
D4Rat48
D1Rat49
D2Rat302
D4Rat80
D1Rat5
D2Rat363
D1Rat55
D2Rat49
D1Rat60
D2Rat52
D1Rat70
D2Rat62
D1Rat89
D2Rat69
D1Rat90
D2Rat84
D2Rat88
D2Rat89
Chr.12
Chr.13
Chr.14
Chr.15
Chr.16
Chr.17
Chr.18
Chr.19
Chr.20
Chr.X
D12Arb13
D13Arb5
D14Arb1
D15Mgh10
D16Arb5
D17Arb4
D18Arb6
D19Rat12
D20Arb10
DXMgh7
D12Arb14
D13Mgh16
D14Arb10
D15Rat102
D16Mgh9
D17Mgh10
D18Mgh3
D19Rat13
D20Mgh1
DXRat104
D12Arb6
D13Mgh7
D14Mgh4
D15Rat106
D16Rat102
D17Mgh5
D18Mit1
D19Rat14
D20Mit4
DXRat116
D12Rat14
D13Mgh9
D14Mit9
D15Rat116
D16Rat14
D17Mgh8
D18Mit9
D19Rat2
D20Rat3
DXRat16
D12Rat15
D13Mit15
D14Rat1
D15Rat126
D16Rat17
D17Mit5
D18Rat111
D19Rat28
D20Rat34
DXRat44
D12Rat25
D13Rat1
D14Rat110
D15Rat138
D16Rat35
D17Rat101
D18Rat12
D19Rat29
D20Rat41
DXRat5
D12Rat32
D13Rat129
D14Rat45
D15Rat17
D16Rat58
D17Rat112
D18Rat132
D19Rat36
D20Rat43
DXRat51
D12Rat43
D13Rat133
D14Rat51
D15Rat29
D16Rat65
D17Rat2
D18Rat137
D19Rat46
D20Rat45
DXRat71
D12Rat50
D13Rat137
D14Rat6
D15Rat43
D16Rat67
D17Rat59
D18Rat30
D19Rat47
D20Rat46
DXRat75
D12Rat52
D13Rat152
D14Rat75
D15Rat5
D16Rat78
D17Rat65
D18Rat53
D19Rat58
D20Rat54
DXRat76
D12Rat59
D13Rat192
D14Rat78
D15Rat52
D16Rat81
D17Rat70
D18Rat57
D19Rat67
D20Rat55
DXRat79
D12Rat65
D13Rat21
D14Rat94
D15Rat69
D16Rat83
D17Rat76
D18Rat62
D19Rat82
D20Rat60
DXRat83
D12Rat93
D13Rat32
D15Rat78
D16Rat93
D17Rat99
D18Rat96
D19Rat97
D20Rat78
D13Rat59
D15Rat8
D13Rat7
D15Rat81
D13Rat72
D15Rat92