遺伝モニタリング
Last Update: March 4, 2010
NBRP-Ratでは、SSLPマーカー(マイクロサテライトマーカー)を用いた遺伝モニタリングを行っています。

使用マーカー
系統間多型率、PCR産物の系統間サイズ差、および染色体上の分散状態を考慮して、以下の20マーカーを選びました。
※マーカー名をクリックするとRGDのページへジャンプします。
検査対象動物と検査時期
1. 胚移植による清浄化を行った系統(全頭): 当施設内系統維持領域搬入時
2. 子宮切断術による清浄化を行った系統(全頭): 当施設内SPF領域搬入時
3. 当施設内系統維持領域とSPF領域で維持している近交系維持ラインの親ペア: 隔年

ゲノムDNAサンプリング
検査対象動物の尾(3mm程度)をカットし、ゲノムDNAを抽出する。
当施設に寄託系統のゲノムDNAが無い場合、寄託機関もしくは維持機関に組織の一部もしくはゲノムDNAを依頼する。

検査結果と評価
遺伝的プロファイルを作製し、寄託時(ゲノムDNA入手時)のプロファイルと比較する。


検査結果例:遺伝的モニタリング使用マーカーと主要系統のPCR産物の大きさ
  ACI/NJcl BN/SsNSlc F344/NSlc IS/Kyo SHR/Izm WKY/Izm LE/Stm
D1Mgh19164 195 326 189 164 164 223
D1Rat126148 123 112 144 112 148 131
D2Rat202195 156 156 189 189 193 154
D2Rat49151 124 157 117 151 121 151
D3Rat80 225 209 225 209 238 209 229
D3Rat24139 139 139 176 176 139 139
D4Rat101228 182 228 184 184 228 198
D5Mgh23121 126 132 117 96 96 128
D5Rat147182 172 174 172 133 180 174
D6Rat105203 225 227 193 195 213 225
D7Rat103218 230 245 239 213 200 243
D9Mit3152 167 173 163 139 139 173
D10Rat223234 244 238 268 246 246 270
D11Rat63250 204 206 225 250 253 250
D14Rat110268 324 283 283 283 283 283
D14Rat75249 259 243 227 220 245 229
D16Rat35272 245 272 274 280 280 262
D18Mit1290 242 247 290 290 249 249
D19Rat12175 214 177 200 173 214 173
DXRat16120 120 126 165 151 165 120